Esposito, Andrea
Esposito, Andrea
DIPARTIMENTO DI FISICA "ETTORE PANCINI"
Predicting chromatin architecture from models of polymer physics
2017 Bianco, Simona; Chiariello, ANDREA MARIA; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario
The scaling features of the 3D organization of chromosomes are highlighted by a transformation a la Kadanoff of Hi-C data
2017 Chiariello, Andrea M.; Bianco, Simona; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario
Structure of the human chromosome interaction network
2017 Sarnataro, Sergio; Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Prisco, Antonella; Nicodemi, Mario
A polymer physics investigation of the architecture of the murine orthologue of the 7q11.23 human locus
2017 Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Fiorillo, Luca; Prisco, Antonella; Nicodemi, Mario
Molecular Dynamics simulations of the Strings and Binders Switch model of chromatin
2018 Annunziatella, Carlo; Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Bianco, Simona; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario
Dynamic 3D chromatin architecture contributes to enhancer specificity and limb morphogenesis
2018 Kragesteen, B. K.; Spielmann, M.; Paliou, C.; Riedel, FRANK HEINRICH; Schoepflin, R.; Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Chiariello, ANDREA MARIA; Jerkovic, I.; Harabula, I.; Guckelberger, P.; Pechstein, M.; Wittler, L.; Chan, W. -L.; Franke, M.; Lupianez, D. G.; Kraft, K.; Timmermann, B.; Vingron, M.; Visel, A.; Nicodemi, Mario; Mundlos, S.; Andrey, G.
Models of polymer physics for the architecture of the cell nucleus
2019 Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario
A Dynamic Folded Hairpin Conformation Is Associated with α-Globin Activation in Erythroid Cells
2020 Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Oudelaar, A. M.; Esposito, A.; Annunziatella, C.; Fiorillo, L.; Conte, M.; Corrado, A.; Prisco, A.; Larke, M. S. C.; Telenius, J. M.; Sciarretta, R.; Musella, F.; Buckle, V. J.; Higgs, D. R.; Hughes, J. R.; Nicodemi, M.
A modern challenge of polymer physics: Novel ways to study, interpret, and reconstruct chromatin structure
2020 Fiorillo, L.; Bianco, S.; Esposito, A.; Conte, M.; Sciarretta, R.; Musella, F.; Chiariello, A. M.
A Polymer Physics Model to Dissect Genome Organization in Healthy and Pathological Phenotypes
2022 Conte, M.; Fiorillo, L.; Bianco, S.; Chiariello, A. M.; Esposito, A.; Musella, F.; Flora, F.; Abraham, A.; Nicodemi, M.
A novel complex genomic rearrangement affecting the KCNJ2 regulatory region causes a variant of Cooks syndrome
2022 Cinque, L.; Micale, L.; Manara, E.; Esposito, A.; Palumbo, O.; Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Guerri, G.; Bertelli, M.; Giuffrida, M. G.; Bernardini, L.; Notarangelo, A.; Nicodemi, M.; Castori, M.
The Strings and Binders Switch Model of Chromatin
2019 Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario
Hmga2 protein loss alters nuclear envelope and 3D chromatin structure
2022 Divisato, Giuseppina; Chiariello, Andrea M; Esposito, Andrea; Zoppoli, Pietro; Zambelli, Federico; Elia, Maria Antonietta; Pesole, Graziano; Incarnato, Danny; Passaro, Fabiana; Piscitelli, Silvia; Oliviero, Salvatore; Nicodemi, Mario; Parisi, Silvia; Russo, Tommaso
Repression and 3D-restructuring resolves regulatory conflicts in evolutionarily rearranged genomes
2022 Ringel, Alessa R; Szabo, Quentin; Chiariello, Andrea M; Chudzik, Konrad; Schöpflin, Robert; Rothe, Patricia; Mattei, Alexandra L; Zehnder, Tobias; Harnett, Dermot; Laupert, Verena; Bianco, Simona; Hetzel, Sara; Glaser, Juliane; Phan, Mai H Q; Schindler, Magdalena; Ibrahim, Daniel M; Paliou, Christina; Esposito, Andrea; Prada-Medina, Cesar A; Haas, Stefan A; Giere, Peter; Vingron, Martin; Wittler, Lars; Meissner, Alexander; Nicodemi, Mario; Cavalli, Giacomo; Bantignies, Frédéric; Mundlos, Stefan; Robson, Michael I
Unveiling the Machinery behind Chromosome Folding by Polymer Physics Modeling
2023 Conte, Mattia; Esposito, Andrea; Vercellone, Francesca; Abraham, Alex; Bianco, Simona
The Physics of DNA Folding: Polymer Models and Phase-Separation
2022 Esposito, Andrea; Abraham, Alex; Conte, Mattia; Vercellone, Francesca; Prisco, Antonella; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.
Polymer Models of Chromatin Imaging Data in Single Cells
2022 Conte, Mattia; Chiariello, Andrea M.; Abraham, Alex; Bianco, Simona; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario; Matteuzzi, Tommaso; Vercellone, Francesca
Multiscale modelling of chromatin 4D organization in SARS-CoV-2 infected cells
2024 Chiariello, Andrea M.; Abraham, Alex; Bianco, Simona; Esposito, Andrea; Fontana, Andrea; Vercellone, Francesca; Conte, Mattia; Nicodemi, Mario
Titolo | Tipologia | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
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Predicting chromatin architecture from models of polymer physics | 1.1 Articolo in rivista | 2017 | Bianco, Simona; Chiariello, ANDREA MARIA; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario | |
The scaling features of the 3D organization of chromosomes are highlighted by a transformation a la Kadanoff of Hi-C data | 1.1 Articolo in rivista | 2017 | Chiariello, Andrea M.; Bianco, Simona; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario | |
Structure of the human chromosome interaction network | 1.1 Articolo in rivista | 2017 | Sarnataro, Sergio; Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Prisco, Antonella; Nicodemi, Mario | |
A polymer physics investigation of the architecture of the murine orthologue of the 7q11.23 human locus | 1.1 Articolo in rivista | 2017 | Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Fiorillo, Luca; Prisco, Antonella; Nicodemi, Mario | |
Molecular Dynamics simulations of the Strings and Binders Switch model of chromatin | 1.1 Articolo in rivista | 2018 | Annunziatella, Carlo; Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Bianco, Simona; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario | |
Dynamic 3D chromatin architecture contributes to enhancer specificity and limb morphogenesis | 1.1 Articolo in rivista | 2018 | Kragesteen, B. K.; Spielmann, M.; Paliou, C.; Riedel, FRANK HEINRICH; Schoepflin, R.; Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Chiariello, ANDREA MARIA; Jerkovic, I.; Harabula, I.; Guckelberger, P.; Pechstein, M.; Wittler, L.; Chan, W. -L.; Franke, M.; Lupianez, D. G.; Kraft, K.; Timmermann, B.; Vingron, M.; Visel, A.; Nicodemi, Mario; Mundlos, S.; Andrey, G. | |
Models of polymer physics for the architecture of the cell nucleus | 1.1 Articolo in rivista | 2019 | Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario | |
A Dynamic Folded Hairpin Conformation Is Associated with α-Globin Activation in Erythroid Cells | 1.1 Articolo in rivista | 2020 | Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Oudelaar, A. M.; Esposito, A.; Annunziatella, C.; Fiorillo, L.; Conte, M.; Corrado, A.; Prisco, A.; Larke, M. S. C.; Telenius, J. M.; Sciarretta, R.; Musella, F.; Buckle, V. J.; Higgs, D. R.; Hughes, J. R.; Nicodemi, M. | |
A modern challenge of polymer physics: Novel ways to study, interpret, and reconstruct chromatin structure | 1.1 Articolo in rivista | 2020 | Fiorillo, L.; Bianco, S.; Esposito, A.; Conte, M.; Sciarretta, R.; Musella, F.; Chiariello, A. M. | |
A Polymer Physics Model to Dissect Genome Organization in Healthy and Pathological Phenotypes | 2.1 Contributo in volume (Capitolo o Saggio) | 2022 | Conte, M.; Fiorillo, L.; Bianco, S.; Chiariello, A. M.; Esposito, A.; Musella, F.; Flora, F.; Abraham, A.; Nicodemi, M. | |
A novel complex genomic rearrangement affecting the KCNJ2 regulatory region causes a variant of Cooks syndrome | 1.1 Articolo in rivista | 2022 | Cinque, L.; Micale, L.; Manara, E.; Esposito, A.; Palumbo, O.; Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Guerri, G.; Bertelli, M.; Giuffrida, M. G.; Bernardini, L.; Notarangelo, A.; Nicodemi, M.; Castori, M. | |
The Strings and Binders Switch Model of Chromatin | 2.1 Contributo in volume (Capitolo o Saggio) | 2019 | Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario | |
Hmga2 protein loss alters nuclear envelope and 3D chromatin structure | 1.1 Articolo in rivista | 2022 | Divisato, Giuseppina; Chiariello, Andrea M; Esposito, Andrea; Zoppoli, Pietro; Zambelli, Federico; Elia, Maria Antonietta; Pesole, Graziano; Incarnato, Danny; Passaro, Fabiana; Piscitelli, Silvia; Oliviero, Salvatore; Nicodemi, Mario; Parisi, Silvia; Russo, Tommaso | |
Repression and 3D-restructuring resolves regulatory conflicts in evolutionarily rearranged genomes | 1.1 Articolo in rivista | 2022 | Ringel, Alessa R; Szabo, Quentin; Chiariello, Andrea M; Chudzik, Konrad; Schöpflin, Robert; Rothe, Patricia; Mattei, Alexandra L; Zehnder, Tobias; Harnett, Dermot; Laupert, Verena; Bianco, Simona; Hetzel, Sara; Glaser, Juliane; Phan, Mai H Q; Schindler, Magdalena; Ibrahim, Daniel M; Paliou, Christina; Esposito, Andrea; Prada-Medina, Cesar A; Haas, Stefan A; Giere, Peter; Vingron, Martin; Wittler, Lars; Meissner, Alexander; Nicodemi, Mario; Cavalli, Giacomo; Bantignies, Frédéric; Mundlos, Stefan; Robson, Michael I | |
Unveiling the Machinery behind Chromosome Folding by Polymer Physics Modeling | 1.1 Articolo in rivista | 2023 | Conte, Mattia; Esposito, Andrea; Vercellone, Francesca; Abraham, Alex; Bianco, Simona | |
The Physics of DNA Folding: Polymer Models and Phase-Separation | 1.1 Articolo in rivista | 2022 | Esposito, Andrea; Abraham, Alex; Conte, Mattia; Vercellone, Francesca; Prisco, Antonella; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M. | |
Polymer Models of Chromatin Imaging Data in Single Cells | 1.2 Recensione in rivista | 2022 | Conte, Mattia; Chiariello, Andrea M.; Abraham, Alex; Bianco, Simona; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario; Matteuzzi, Tommaso; Vercellone, Francesca | |
Multiscale modelling of chromatin 4D organization in SARS-CoV-2 infected cells | 1.1 Articolo in rivista | 2024 | Chiariello, Andrea M.; Abraham, Alex; Bianco, Simona; Esposito, Andrea; Fontana, Andrea; Vercellone, Francesca; Conte, Mattia; Nicodemi, Mario |