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DI BERNARDO, DIEGO

DI BERNARDO, DIEGO  

DIPARTIMENTO DI INGEGNERIA CHIMICA, DEI MATERIALI E DELLA PRODUZIONE INDUSTRIALE  

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Titolo Tipologia Data di pubblicazione Autore(i) File
The transcriptional landscape of the mammalian genome 1.1 Articolo in rivista 2005 Carninci, P.; Kasukawa, T.; Katayama, S.; Gough, J.; Frith, M. C.; Maeda, N.; Oyama, R.; Ravasi, T.; Lenhard, B.; Wells, C.; Kodzius, R.; Shimokawa, K.; Bajic, V. B.; Brenner, S. E.; Batalov, S.; Forrest, A. R.; Zavolan, M.; Davis, M. J.; Wilming, L. G.; Aidinis, V.; Allen, J. E.; Ambesi Impiombato, A.; Apweiler, R.; Aturaliya, R. N.; Bailey, T. L.; Bansal, M.; Baxter, L.; Beisel, K. W.; Bersano, T.; Bono, H.; Chalk, A. M.; Chiu, K. P.; Choudhary, V.; Christoffels, A.; Clutterbuck, D. R.; Crowe, M. L.; Dalla, E.; Dalrymple, B. P.; de Bono, B.; Della Gatta, G.; DI BERNARDO, Diego; Down, T.; Engstrom, P.; Fagiolini, M.; Faulkner, G.; Fletcher, C. F.; Fukushima, T.; Furuno, M.; Futaki, S.; Gariboldi, M.; Georgii Hemming, P.; Gingeras, T. R.; Gojobori, T.; Green, R. E.; Gustincich, S.; Harbers, M.; Hayashi, Y.; Hensch, T. K.; Hirokawa, N.; Hill, D.; Huminiecki, L.; Iacono, M.; Ikeo, K.; Iwama, A.; Ishikawa, T.; Jakt, M.; Kanapin, A.; Katoh, M.; Kawasawa, Y.; Kelso, J.; Kitamura, H.; Kitano, H.; Kollias, G.; Krishnan, S. P.; Kruger, A.; Kummerfeld, S. K.; Kurochkin, I. V.; Lareau, L. F.; Lazarevic, D.; Lipovich, L.; Liu, J.; Liuni, S.; Mcwilliam, S.; Madan Babu, M.; Madera, M.; Marchionni, L.; Matsuda, H.; Matsuzawa, S.; Miki, H.; Mignone, F.; Miyake, S.; Morris, K.; Mottagui Tabar, S.; Mulder, N.; Nakano, N.; Nakauchi, H.; Ng, P.; Nilsson, R.; Nishiguchi, S.; Nishikawa, S.; Nori, F.; Ohara, O.; Okazaki, Y.; Orlando, V.; Pang, K. C.; Pavan, W. J.; Pavesi, G.; Pesole, G.; Petrovsky, N.; Piazza, S.; Reed, J.; Reid, J. F.; Ring, B. Z.; Ringwald, M.; Rost, B.; Ruan, Y.; Salzberg, S. L.; Sandelin, A.; Schneider, C.; Schonbach, C.; Sekiguchi, K.; Semple, C. A.; Seno, S.; Sessa, L.; Sheng, Y.; Shibata, Y.; Shimada, H.; Shimada, K.; Silva, D.; Sinclair, B.; Sperling, S.; Stupka, E.; Sugiura, K.; Sultana, R.; Takenaka, Y.; Taki, K.; Tammoja, K.; Tan, S. L.; Tang, S.; Taylor, M. S.; Tegner, J.; Teichmann, S. A.; Ueda, H. R.; van Nimwegen, E.; Verardo, R.; Wei, C. L.; Yagi, K.; Yamanishi, H.; Zabarovsky, E.; Zhu, S.; Zimmer, A.; Hide, W.; Bult, C.; Grimmond, S. M.; Teasdale, R. D.; Liu, E. T.; Brusic, V.; Quackenbush, J.; Wahlestedt, C.; Mattick, J. S.; Hume, D. A.; Kai, C.; Sasaki, D.; Tomaru, Y.; Fukuda, S.; Kanamori Katayama, M.; Suzuki, M.; Aoki, J.; Arakawa, T.; Iida, J.; Imamura, K.; Itoh, M.; Kato, T.; Kawaji, H.; Kawagashira, N.; Kawashima, T.; Kojima, M.; Kondo, S.; Konno, H.; Nakano, K.; Ninomiya, N.; Nishio, T.; Okada, M.; Plessy, C.; Shibata, K.; Shiraki, T.; Suzuki, S.; Tagami, M.; Waki, K.; Watahiki, A.; Okamura Oho, Y.; Suzuki, H.; Kawai, J.; Hayashizaki, Y.
A multi-step approach to time series analysis and gene expression clustering 1.1 Articolo in rivista 2006 Amato, R.; Ciaramella, A.; Deniskina, N.; Del Mondo, C.; DI BERNARDO, Diego; Donalek, C.; Longo, Giuseppe; Mangano, G.; Miele, Gennaro; Raiconi, G.; Staiano, A.; Tagliaferri, R.
CoGemiR: a comparative genomics microRNA database. 1.1 Articolo in rivista 2008 V., Maselli; DI BERNARDO, Diego; S., Banfi
A MULTI-STEP APPROACH TO TIME SERIES ANALYSIS AND GENE EXPRESSION CLUSTERING 1.1 Articolo in rivista 2006 Longo, Giuseppe; Amato, R.; Ciaramella, A.; DEL MONDO, C.; DI BERNARDO, Diego; Donalek, C.; Mangano, G.; Miele, Gennaro; Raiconi, G.; Staiano, A.; Tagliaferri, R.
Inferring genetic networks and identifying compound mode of action via expression profiling. 1.1 Articolo in rivista 2003 Gardner, Ts; DI BERNARDO, Diego; Lorenz, D; Collins, Jj
Linear matrix inequalities approach to reconstruction of biological networks. 1.1 Articolo in rivista 2007 Cosentino, C; Curatola, W; Montefusco, F; Bansal, M; DI BERNARDO, Diego; Amato, F.
COBIOS Control and Engineering of Biological Systems 8.07 Progetti di Ricerca Finanziati 2007 DI BERNARDO, Diego
Transcriptional network dynamics in macrophage activation 1.1 Articolo in rivista 2006 Nilsson, R.; Bajic, V. B.; Suzuki, H.; DI BERNARDO, Diego; Bjorkegren, J.; Katayama, S.; Reid, J. F.; Sweet, M. J.; Gariboldi, M.; Carninci, P.; Hayashizaki, Y.; Hume, D. A.; Tegner, J.; Ravasi, T.
Chemogenomic profiling on a genome-wide scale using reverse-engineered gene networks 1.1 Articolo in rivista 2005 DI BERNARDO, Diego; Thompson, M. J.; Gardner, T. S.; Chobot, S. E.; Eastwood, E. L.; Wojtovich, A. P.; Elliott, S. J.; Schaus, S. E.; Collins, J. J.
Robust identification of large genetic networks 1.1 Articolo in rivista 2004 DI BERNARDO, Diego; Gardner, T. S.; Collins, J. J.
Computational framework for the prediction of transcription factor binding sites by multiple data integration 1.1 Articolo in rivista 2006 Ambesi Impiombato, A; Bansal, M; Lio, P; DI BERNARDO, Diego
Segmentation, tracking and lineage analysis of yeast cells in bright field microscopy images 1.1 Articolo in rivista 2012 R., La Brocca; F., Menolascina; DI BERNARDO, Diego; Sansone, Carlo
Dispersion of QT intervals: a measure of dispersion of repolarization or simply a projection effect? 1.1 Articolo in rivista 2000 DI BERNARDO, Diego; Langley, P.; Murray, A.
Differential network analysis for the identification of condition-specific pathway activity and regulation. 1.1 Articolo in rivista 2013 Gambardella, G; Moretti, Mn; de Cegli, R; Cardone, L; Peron, Adriano; DI BERNARDO, Diego
TFEB controls cellular lipid metabolism through a starvation-induced autoregulatory loop. 1.1 Articolo in rivista 2013 Settembre, Carmine; De Cegli, R; Mansueto, G; Saha, Pk; Vetrini, F; Visvikis, O; Huynh, T; Carissimo, A; Palmer, D; Klisch, Tj; Wollenberg, Ac; DI BERNARDO, Diego; Chan, L; Irazoqui, Je; Ballabio, Andrea
Reverse engineering transcriptional gene networks. 2.1 Contributo in volume (Capitolo o Saggio) 2014 Belcastro, V; DI BERNARDO, Diego
Systems and Synthetic biology: tackling genetic networks and complex diseases 1.1 Articolo in rivista 2009 G., Cuccato; G. D., Gatta; DI BERNARDO, Diego
Network based elucidation of drug response: from modulators to targets. 1.1 Articolo in rivista 2013 Iorio, F; Saez Rodriguez, J; DI BERNARDO, Diego
Combining Flux Balance Analysis and Model Checking for Metabolic Network Validation and Analysis. 1.1 Articolo in rivista 2015 Pagliarini, Roberto; Sangiovanni, Mara; Peron, Adriano; DI BERNARDO, Diego
Direct targets of the Trp63 transcription factor revealed by a combination of gene expression profiling and reverse engineering. 1.1 Articolo in rivista 2008 G., Della Gatta; M., Bansal; A., Ambesiimpiombato; Antonini, Dario; Missero, Caterina; DI BERNARDO, Diego