FIORILLO, LUCA
FIORILLO, LUCA
DIPARTIMENTO DI FISICA "ETTORE PANCINI"
A polymer physics investigation of the architecture of the murine orthologue of the 7q11.23 human locus
2017 Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Fiorillo, Luca; Prisco, Antonella; Nicodemi, Mario
Molecular Dynamics simulations of the Strings and Binders Switch model of chromatin
2018 Annunziatella, Carlo; Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Bianco, Simona; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario
Models of polymer physics for the architecture of the cell nucleus
2019 Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario
Inference of chromosome 3D structures from GAM data by a physics computational approach
2020 Fiorillo, L.; Bianco, S.; Chiariello, A. M.; Barbieri, M.; Esposito, A.; Annunziatella, C.; Conte, M.; Corrado, A.; Prisco, A.; Pombo, A.; Nicodemi, M.
Modeling Single-Molecule Conformations of the HoxD Region in Mouse Embryonic Stem and Cortical Neuronal Cells
2019 Bianco, S.; Annunziatella, C.; Andrey, G.; Chiariello, A. M.; Esposito, A.; Fiorillo, L.; Prisco, A.; Conte, Mattia; Campanile, Raffaele; Nicodemi, M.
A Dynamic Folded Hairpin Conformation Is Associated with α-Globin Activation in Erythroid Cells
2020 Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Oudelaar, A. M.; Esposito, A.; Annunziatella, C.; Fiorillo, L.; Conte, M.; Corrado, A.; Prisco, A.; Larke, M. S. C.; Telenius, J. M.; Sciarretta, R.; Musella, F.; Buckle, V. J.; Higgs, D. R.; Hughes, J. R.; Nicodemi, M.
Computational approaches from polymer physics to investigate chromatin folding
2020 Bianco, S.; Chiariello, A. M.; Conte, M.; Esposito, A.; Fiorillo, L.; Musella, F.; Nicodemi, M.
Divergent Transcription of the Nkx2-5 Locus Generates Two Enhancer RNAs with Opposing Functions
2020 Salamon, I.; Serio, S.; Bianco, S.; Pagiatakis, C.; Crasto, S.; Chiariello, A. M.; Conte, M.; Cattaneo, P.; Fiorillo, L.; Felicetta, A.; di Pasquale, E.; Kunderfranco, P.; Nicodemi, M.; Papait, R.; Condorelli, G.
Comparison of the Hi-C, GAM and SPRITE methods using polymer models of chromatin
2021 Fiorillo, L.; Musella, F.; Conte, M.; Kempfer, R.; Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Kukalev, A.; Irastorza-Azcarate, I.; Esposito, A.; Abraham, A.; Prisco, A.; Pombo, A.; Nicodemi, M.
Cell-type specialization is encoded by specific chromatin topologies
2021 Winick-Ng, W.; Kukalev, A.; Harabula, I.; Zea-Redondo, L.; Szabo, D.; Meijer, M.; Serebreni, L.; Zhang, Y.; Bianco, S.; Chiariello, A. M.; Irastorza-Azcarate, I.; Thieme, C. J.; Sparks, T. M.; Carvalho, S.; Fiorillo, L.; Musella, F.; Irani, E.; Triglia, E. T.; Kolodziejczyk, A. A.; Abentung, A.; Apostolova, G.; Paul, E. J.; Franke, V.; Kempfer, R.; Akalin, A.; Teichmann, S. A.; Dechant, G.; Ungless, M. A.; Nicodemi, M.; Welch, L.; Castelo-Branco, G.; Pombo, A.
The Strings and Binders Switch Model of Chromatin
2019 Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario
Polymer physics reveals a combinatorial code linking 3D chromatin architecture to 1D chromatin states
2022 Esposito, Andrea; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Abraham, Alex; Fiorillo, Luca; Conte, Mattia; Campanile, Raffaele; Nicodemi, Mario
Comparison of the Hi-C, GAM and SPRITE methods by use of polymer models of chromatin
2020 Fiorillo, Luca; Musella, Francesco; Kempfer, Rieke; Chiariello, Andrea M.; Bianco, Simona; Kukalev, Alexander; Irastorza-Azcarate, Ibai; Esposito, Andrea; Conte, Mattia; Prisco, Antonella; Pombo, Ana; Nicodemi, Mario
Dynamic and equilibrium properties of finite-size polymer models of chromosome folding
2021 Conte, Mattia; Fiorillo, Luca; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Musella, Francesco; Abraham, Alex; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.
Efficient computational implementation of polymer physics models to explore chromatin structure
2022 Conte, Mattia; Esposito, Andrea; Fiorillo, Luca; Campanile, Raffaele; Annunziatella, Carlo; Corrado, Alfonso; Chiariello, Maria Gabriella; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.
Polymer physics indicates chromatin folding variability across single-cells results from state degeneracy in phase separation
2020 Conte, Mattia; Fiorillo, Luca; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario
Titolo | Tipologia | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
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A polymer physics investigation of the architecture of the murine orthologue of the 7q11.23 human locus | 1.1 Articolo in rivista | 2017 | Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Fiorillo, Luca; Prisco, Antonella; Nicodemi, Mario | |
Molecular Dynamics simulations of the Strings and Binders Switch model of chromatin | 1.1 Articolo in rivista | 2018 | Annunziatella, Carlo; Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Bianco, Simona; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario | |
Models of polymer physics for the architecture of the cell nucleus | 1.1 Articolo in rivista | 2019 | Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario | |
Inference of chromosome 3D structures from GAM data by a physics computational approach | 1.1 Articolo in rivista | 2020 | Fiorillo, L.; Bianco, S.; Chiariello, A. M.; Barbieri, M.; Esposito, A.; Annunziatella, C.; Conte, M.; Corrado, A.; Prisco, A.; Pombo, A.; Nicodemi, M. | |
Modeling Single-Molecule Conformations of the HoxD Region in Mouse Embryonic Stem and Cortical Neuronal Cells | 1.1 Articolo in rivista | 2019 | Bianco, S.; Annunziatella, C.; Andrey, G.; Chiariello, A. M.; Esposito, A.; Fiorillo, L.; Prisco, A.; Conte, Mattia; Campanile, Raffaele; Nicodemi, M. | |
A Dynamic Folded Hairpin Conformation Is Associated with α-Globin Activation in Erythroid Cells | 1.1 Articolo in rivista | 2020 | Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Oudelaar, A. M.; Esposito, A.; Annunziatella, C.; Fiorillo, L.; Conte, M.; Corrado, A.; Prisco, A.; Larke, M. S. C.; Telenius, J. M.; Sciarretta, R.; Musella, F.; Buckle, V. J.; Higgs, D. R.; Hughes, J. R.; Nicodemi, M. | |
Computational approaches from polymer physics to investigate chromatin folding | 1.1 Articolo in rivista | 2020 | Bianco, S.; Chiariello, A. M.; Conte, M.; Esposito, A.; Fiorillo, L.; Musella, F.; Nicodemi, M. | |
Divergent Transcription of the Nkx2-5 Locus Generates Two Enhancer RNAs with Opposing Functions | 1.1 Articolo in rivista | 2020 | Salamon, I.; Serio, S.; Bianco, S.; Pagiatakis, C.; Crasto, S.; Chiariello, A. M.; Conte, M.; Cattaneo, P.; Fiorillo, L.; Felicetta, A.; di Pasquale, E.; Kunderfranco, P.; Nicodemi, M.; Papait, R.; Condorelli, G. | |
Comparison of the Hi-C, GAM and SPRITE methods using polymer models of chromatin | 1.1 Articolo in rivista | 2021 | Fiorillo, L.; Musella, F.; Conte, M.; Kempfer, R.; Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Kukalev, A.; Irastorza-Azcarate, I.; Esposito, A.; Abraham, A.; Prisco, A.; Pombo, A.; Nicodemi, M. | |
Cell-type specialization is encoded by specific chromatin topologies | 1.1 Articolo in rivista | 2021 | Winick-Ng, W.; Kukalev, A.; Harabula, I.; Zea-Redondo, L.; Szabo, D.; Meijer, M.; Serebreni, L.; Zhang, Y.; Bianco, S.; Chiariello, A. M.; Irastorza-Azcarate, I.; Thieme, C. J.; Sparks, T. M.; Carvalho, S.; Fiorillo, L.; Musella, F.; Irani, E.; Triglia, E. T.; Kolodziejczyk, A. A.; Abentung, A.; Apostolova, G.; Paul, E. J.; Franke, V.; Kempfer, R.; Akalin, A.; Teichmann, S. A.; Dechant, G.; Ungless, M. A.; Nicodemi, M.; Welch, L.; Castelo-Branco, G.; Pombo, A. | |
The Strings and Binders Switch Model of Chromatin | 2.1 Contributo in volume (Capitolo o Saggio) | 2019 | Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario | |
Polymer physics reveals a combinatorial code linking 3D chromatin architecture to 1D chromatin states | 1.1 Articolo in rivista | 2022 | Esposito, Andrea; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Abraham, Alex; Fiorillo, Luca; Conte, Mattia; Campanile, Raffaele; Nicodemi, Mario | |
Comparison of the Hi-C, GAM and SPRITE methods by use of polymer models of chromatin | 1.1 Articolo in rivista | 2020 | Fiorillo, Luca; Musella, Francesco; Kempfer, Rieke; Chiariello, Andrea M.; Bianco, Simona; Kukalev, Alexander; Irastorza-Azcarate, Ibai; Esposito, Andrea; Conte, Mattia; Prisco, Antonella; Pombo, Ana; Nicodemi, Mario | |
Dynamic and equilibrium properties of finite-size polymer models of chromosome folding | 1.1 Articolo in rivista | 2021 | Conte, Mattia; Fiorillo, Luca; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Musella, Francesco; Abraham, Alex; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M. | |
Efficient computational implementation of polymer physics models to explore chromatin structure | 1.1 Articolo in rivista | 2022 | Conte, Mattia; Esposito, Andrea; Fiorillo, Luca; Campanile, Raffaele; Annunziatella, Carlo; Corrado, Alfonso; Chiariello, Maria Gabriella; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M. | |
Polymer physics indicates chromatin folding variability across single-cells results from state degeneracy in phase separation | 1.1 Articolo in rivista | 2020 | Conte, Mattia; Fiorillo, Luca; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario |