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Induction of Nitric-Oxide Metabolism in Enterocytes Alleviates Colitis and Inflammation-Associated Colon Cancer 1.1 Articolo in rivista 2018 Stettner, Noa; Rosen, Chava; Bernshtein, Biana; Gur-Cohen, Shiri; Frug, Julia; Silberman, Alon; Sarver, Alona; Carmel-Neiderman, Narin N.; Eilam, Raya; Biton, Inbal; Pevsner-Fischer, Meirav; Zmora, Niv; Brandis, Alexander; Bahar Halpern, Keren; Mazkereth, Ram; di Bernardo, Diego; Brunetti-Pierri, Nicola; Premkumar, Muralidhar H.; Dank, Gillian; Nagamani, Sandesh C. S.; Jung, Steffen; Harmelin, Alon; Erez, Ayelet
The impact of microRNAs on transcriptional heterogeneity and gene co-expression across single embryonic stem cells 1.1 Articolo in rivista 2017 Gambardella, Gennaro; Carissimo, Annamaria; Chen, Amy; Cutillo, Luisa; Nowakowski, Tomasz J; DI BERNARDO, Diego; Blelloch, Robert
gene2drug: a Computational Tool for Pathway-based Rational Drug Repositioning 1.1 Articolo in rivista 2017 Napolitano, Francesco; Carrella, Diego; Mandriani, Barbara; Pisonero, Sandra; Sirci, Francesco; Medina, Diego; Brunetti-Pierri, Nicola; di Bernardo, Diego; MEDINA SANABRIA, Diego Luis
Comparing structural and transcriptional drug networks reveals signatures of drug activity and toxicity in transcriptional responses 1.1 Articolo in rivista 2017 Sirci, Francesco; Napolitano, Francesco; Pisonero-Vaquero, Sandra; Carrella, Diego; Medina, Diego L; di Bernardo, Diego; MEDINA SANABRIA, Diego Luis
PML-RARA-associated cooperating mutations belong to a transcriptional network that is deregulated in myeloid leukemias 1.1 Articolo in rivista 2017 Ronchini, C; Brozzi, A; Riva, L; Luzi, L; Gruszka, A. M; Melloni, G. E. M; Scanziani, E; Dharmalingam, G; Mutarelli, M; Belcastro, V; Lavorgna, S; Rossi, V; Spinelli, O; Biondi, A; Rambaldi, A; Lo Coco, F; DI BERNARDO, Diego; Pelicci, P. G.
In Silico Modeling of Liver Metabolism in a Human Disease Reveals a Key Enzyme for Histidine and Histamine Homeostasis 1.1 Articolo in rivista 2016 Pagliarini, Roberto; Castello, Raffaele; Napolitano, Francesco; Borzone, Roberta; Annunziata, Patrizia; Mandrile, Giorgia; De Marchi, Mario; BRUNETTI PIERRI, Nicola; DI BERNARDO, Diego
Evaluation of a systems biology approach to identify pharmacological correctors of the mutant CFTR chloride channel 1.1 Articolo in rivista 2016 Pesce, Emanuela; Gorrieri, Giulia; Sirci, Francesco; Napolitano, Francesco; Carrella, Diego; Caci, Emanuela; Tomati, Valeria; Zegarra Moran, Olga; DI BERNARDO, Diego; Galietta, Luis J. V.
Computational drugs repositioning identifies inhibitors of oncogenic PI3K/AKT/P70S6K-dependent pathways among FDA-approved compounds 1.1 Articolo in rivista 2016 Carrella, Diego; Manni, Isabella; Tumaini, Barbara; Dattilo, Rosanna; Papaccio, Federica; Mutarelli, Margherita; Sirci, Francesco; Amoreo, Carla A; Mottolese, Marcella; Iezzi, Manuela; Ciolli, Laura; Aria, Valentina; Bosotti, Roberta; Isacchi, Antonella; Loreni, Fabrizio; Bardelli, Alberto; Avvedimento, VITTORIO ENRICO; DI BERNARDO, Diego; Cardone, Luca
From a discrete to continuous actuation for improved real-time control of gene expression in mammalian cells 1.1 Articolo in rivista 2016 Postiglione, Lorena; Santorelli, Marco; Tumaini, Barbara; DI BERNARDO, Diego
In Vivo Real-Time Control of Gene Expression: A Comparative Analysis of Feedback Control Strategies in Yeast 1.1 Articolo in rivista 2016 Fiore, Gianfranco; Perrino, Giansimone; DI BERNARDO, Mario; DI BERNARDO, Diego
Unravelling druggable signalling networks that control F508del-CFTR proteostasis 1.1 Articolo in rivista 2016 Hegde, Ramanath Narayana; Parashuraman, Seetharaman; Iorio, Francesco; Ciciriello, Fabiana; Capuani, Fabrizio; Carissimo, Annamaria; Carrella, Diego; Belcastro, Vincenzo; Subramanian, Advait; Bounti, Laura; Persico, Maria; Carlile, Graeme; Galietta, Luis; Thomas, David Y; DI BERNARDO, Diego; Luini, Alberto
Goblet Cell Hyperplasia Requires High Bicarbonate Transport to Support Mucin Release 1.1 Articolo in rivista 2016 Gorrieri, Giulia; Scudieri, Paolo; Caci, Emanuela; Schiavon, Marco; Tomati, Valeria; Sirci, Francesco; Napolitano, Francesco; Carrella, Diego; Gianotti, Ambra; Musante, Ilaria; Favia, Maria; Casavola, Valeria; Guerra, Lorenzo; Rea, Federico; Ravazzolo, Roberto; DI BERNARDO, Diego; Galietta, Luis J. V.
Autophagosome-lysosome fusion triggers a lysosomal response mediated by TLR9 and controlled by OCRL 1.1 Articolo in rivista 2016 De Leo, Maria Giovanna; Staiano, Leopoldo; Vicinanza, Mariella; Luciani, Alessandro; Carissimo, Annamaria; Mutarelli, Margherita; Di Campli, Antonella; Polishchuk, Elena; Di Tullio, Giuseppe; Morra, Valentina; Levtchenko, Elena; Oltrabella, Francesca; Starborg, Tobias; Santoro, Michele; DI BERNARDO, Diego; Devuyst, Olivier; Lowe, Martin; Medina, Diego L.; Ballabio, Andrea; DE MATTEIS, Maria Antonietta; MEDINA SANABRIA, Diego Luis
High-resolution analysis of the human retina miRNome reveals isomiR variations and novel microRNAs 1.1 Articolo in rivista 2016 Karali, Marianthi; Persico, Maria; Mutarelli, Margherita; Carissimo, Annamaria; Pizzo, Mariateresa; Singh Marwah, Veer; Ambrosio, Concetta; Pinelli, Michele; Carrella, Diego; Ferrari, Stefano; Ponzin, Diego; Nigro, Vincenzo; DI BERNARDO, Diego; Banfi, Sandro
An atlas of gene expression and gene co-regulation in the human retina 1.1 Articolo in rivista 2016 Pinelli, Michele; Carissimo, Annamaria; Cutillo, Luisa; Lai, Ching Hung; Mutarelli, Margherita; Moretti, Maria Nicoletta; Singh, Marwah Veer; Karali, Marianthi; Carrella, Diego; Pizzo, Mariateresa; Russo, Francesco; Ferrari, Stefano; Ponzin, Diego; Angelini, Claudia; Banfi, Sandro; DI BERNARDO, Diego
Blood transcriptomics of drug-naïve sporadic Parkinson's disease patients 1.1 Articolo in rivista 2015 Calligaris, Raffaella; Banica, Mihaela; Roncaglia, Paola; Robotti, Elisa; Finaurini, Sara; Vlachouli, Christina; Antonutti, Lucia; Iorio, Francesco; Carissimo, Annamaria; Cattaruzza, Tatiana; Ceiner, Andrea; Lazarevic, Dejan; Cucca, Alberto; Pangher, Nicola; Marengo, Emilio; DI BERNARDO, Diego; Pizzolato, Gilberto; Gustincich, Stefano
Deficiency of multidrug resistance 2 contributes to cell transformation through oxidative stress 1.1 Articolo in rivista 2015 Tebbi, Ali; Levillayer, Florence; Jouvion, Grégory; Fiette, Laurence; Soubigou, Guillaume; Varet, Hugo; Boudjadja, Nesrine; Cairo, Stefano; Hashimoto, Kosuke; Suzuki, Ana Maria; Carninci, Piero; Carissimo, Annamaria; DI BERNARDO, Diego; Wei, Yu
Drug-set enrichment analysis: a novel tool to investigate drug mode of action 1.1 Articolo in rivista 2015 Napolitano, Francesco; Sirci, Francesco; Carrella, Diego; DI BERNARDO, Diego
Combining Flux Balance Analysis and Model Checking for Metabolic Network Validation and Analysis. 1.1 Articolo in rivista 2015 Pagliarini, Roberto; Sangiovanni, Mara; Peron, Adriano; DI BERNARDO, Diego
Metabolic regulation of the ultradian oscillator Hes1 by reactive oxygen species. 1.1 Articolo in rivista 2015 Ventre, S; Indrieri, A; Fracassi, C; Franco, Brunella; Conte, I; Cardone, L; DI BERNARDO, Diego; Conte, Ivan
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