Lo scopo di questo programma di ricerca e' quello di combinare tecniche diverse e complementari disponibili presso le unita' partecipanti e di applicarle allo studio delle interazioni fra alcune proteine che hanno la proprieta' di legare piccole molecole idrofobiche con ligandi specifici o con composti ad essi strutturalmente correlati. Le tecniche disponibili sono quelle piu' utilizzate dalla moderna analisi strutturale delle macromolecole biologiche e cioe' la cristallografia ai raggi X, la spettroscopia NMR, U.V., visibile e di fluorescenza, la spettrometria di massa, il mappaggio di epitopi ed altri metodi immunologici oltre ai metodi elettroforetici sofisticati e ai metodi chimici convenzionali di sequenza. Le proteine scelte rappresentano l'intero spettro di proteine leganti molecole idrofobiche e sono oggetto di intensa attivita' di ricerca da parte di molti gruppi importanti di tutto il mondo. In questo studio verranno studiate le proprieta' della siero albumina umana, che costituisce probabilmente l'esempio piu' studiato di proteina di trasporto e dei suoi frammenti stabili, . La nostra lista comprende inoltre tre lipocaline, membri di una famiglia strutturale molto nota, l'alfa1 microglobulina, la beta lattoglobulina e la prostaglandina D sintetasi (beta trace). Quest'ultima proteina e' la prima lipocalina nella quale si sia dimostrata la presenza di attivita' enzimatica. Appartenente ad una famiglia vicina strutturalmente alle lipocaline e' la fatty acid-binding protein (basica) da fegato di pollo che e' una piccola proteina appartenente alla famiglia di trasportatori di lipofili intracellulari (l'albumina e le lipocaline sono infatti extracellulari). Riboflavin-binding protein e folate-binding protein appartengono alla stessa famiglia strutturale che comprende anche i recettori del folato, proteine estrinseche di membrana coinvolte nella assimilazione del folato e alterate in alcuni processi neoplastici. Di questa famiglia di proteine, la piu' nota e' la riboflavin-binding protein dell'albume di uovo di gallina che e' anche l'unica della quale sia stata determinata la struttura tridimensionale per diffrazione dei raggi X. La clusterina e' una proteina da poco individuata, ampiamente distribuita nei vari tessuti e conservata tra i mammiferi. Le sue proprieta' di legame per molecole idrofobiche la assimilano alle altre proteine di questo progetto anche se appartiene ad una famiglia non ancora definita. Ad ognuna delle proteine della lista cercheremo di applicare tutte le tecniche di cui disponiamo con lo scopo finale di descriverne nel modo piu' dettagliato possibile la struttura e il meccanismo di riconoscimento del ligando.

TOPOLOGIA DI COMPLESSI PROTEINA-LIGANDI IDROFOBICI MEDIANTE SPETTROMETRIA DI MASSA / Pucci, Pietro. - (2000). (Intervento presentato al convegno Studi strutturali su proteine che legano molecole idrofobiche nel 20/12/2000).

TOPOLOGIA DI COMPLESSI PROTEINA-LIGANDI IDROFOBICI MEDIANTE SPETTROMETRIA DI MASSA

PUCCI, PIETRO
2000

Abstract

Lo scopo di questo programma di ricerca e' quello di combinare tecniche diverse e complementari disponibili presso le unita' partecipanti e di applicarle allo studio delle interazioni fra alcune proteine che hanno la proprieta' di legare piccole molecole idrofobiche con ligandi specifici o con composti ad essi strutturalmente correlati. Le tecniche disponibili sono quelle piu' utilizzate dalla moderna analisi strutturale delle macromolecole biologiche e cioe' la cristallografia ai raggi X, la spettroscopia NMR, U.V., visibile e di fluorescenza, la spettrometria di massa, il mappaggio di epitopi ed altri metodi immunologici oltre ai metodi elettroforetici sofisticati e ai metodi chimici convenzionali di sequenza. Le proteine scelte rappresentano l'intero spettro di proteine leganti molecole idrofobiche e sono oggetto di intensa attivita' di ricerca da parte di molti gruppi importanti di tutto il mondo. In questo studio verranno studiate le proprieta' della siero albumina umana, che costituisce probabilmente l'esempio piu' studiato di proteina di trasporto e dei suoi frammenti stabili, . La nostra lista comprende inoltre tre lipocaline, membri di una famiglia strutturale molto nota, l'alfa1 microglobulina, la beta lattoglobulina e la prostaglandina D sintetasi (beta trace). Quest'ultima proteina e' la prima lipocalina nella quale si sia dimostrata la presenza di attivita' enzimatica. Appartenente ad una famiglia vicina strutturalmente alle lipocaline e' la fatty acid-binding protein (basica) da fegato di pollo che e' una piccola proteina appartenente alla famiglia di trasportatori di lipofili intracellulari (l'albumina e le lipocaline sono infatti extracellulari). Riboflavin-binding protein e folate-binding protein appartengono alla stessa famiglia strutturale che comprende anche i recettori del folato, proteine estrinseche di membrana coinvolte nella assimilazione del folato e alterate in alcuni processi neoplastici. Di questa famiglia di proteine, la piu' nota e' la riboflavin-binding protein dell'albume di uovo di gallina che e' anche l'unica della quale sia stata determinata la struttura tridimensionale per diffrazione dei raggi X. La clusterina e' una proteina da poco individuata, ampiamente distribuita nei vari tessuti e conservata tra i mammiferi. Le sue proprieta' di legame per molecole idrofobiche la assimilano alle altre proteine di questo progetto anche se appartiene ad una famiglia non ancora definita. Ad ognuna delle proteine della lista cercheremo di applicare tutte le tecniche di cui disponiamo con lo scopo finale di descriverne nel modo piu' dettagliato possibile la struttura e il meccanismo di riconoscimento del ligando.
2000
TOPOLOGIA DI COMPLESSI PROTEINA-LIGANDI IDROFOBICI MEDIANTE SPETTROMETRIA DI MASSA / Pucci, Pietro. - (2000). (Intervento presentato al convegno Studi strutturali su proteine che legano molecole idrofobiche nel 20/12/2000).
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/11588/458649
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