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DNA Methylation Levels in Mononuclear Leukocytes from the Mother and Her Child Are Associated with IgE Sensitization to Allergens in Early Life 1.1 Articolo in rivista 2021 Acevedo, Nathalie; Scala, Giovanni; Merid, Simon Kebede; Frumento, Paolo; Bruhn, Sören; Andersson, Anna; Ogris, Christoph; Bottai, Matteo; Pershagen, Göran; Koppelman, Gerard H; Melén, Erik; Sonnhammer, Erik; Alm, Johan; Söderhäll, Cilla; Kere, Juha; Greco, Dario; Scheynius, Annika
DNA sequence context as a marker of CpG methylation instability in normal and cancer tissues 1.1 Articolo in rivista 2020 Scala, Giovanni; Federico, Antonio; Palumbo, Domenico; Cocozza, Sergio; Greco, Dario
Carbon Nanomaterials Promote M1/M2 Macrophage Activation 1.1 Articolo in rivista 2020 Kinaret, Pia Anneli Sofia; Scala, Giovanni; Federico, Antonio; Sund, Jukka; Greco, Dario
Toxicogenomics analysis of dynamic dose-response in macrophages highlights molecular alterations relevant for multi-walled carbon nanotube-induced lung fibrosis 1.1 Articolo in rivista 2020 Saarimäki, Laura A.; Kinaret, Pia A. S.; Scala, Giovanni; del Giudice, Giusy; Federico, Antonio; Serra, Angela; Greco, Dario
Knowledge generation with rule induction in cancer Omics 1.8 Articolo in rassegna (review) 2020 Scala, G.; Federico, A.; Fortino, V.; Greco, D.; Majello, B.
Feature set optimization in biomarker discovery from genome scale data 1.1 Articolo in rivista 2020 Fortino, V; Scala, G; Greco, D
The genomic landscape of 8-oxodG reveals enrichment at specific inherently fragile promoters 1.1 Articolo in rivista 2020 Gorini, Francesca; Scala, Giovanni; Di Palo, Giacomo; Dellino, Gaetano Ivan; Cocozza, Sergio; Pelicci, Pier Giuseppe; Lania, Luigi; Majello, Barbara; Amente, Stefano
Immune‐microbiota interaction in Finnish and Russian Karelia young people with high and low allergy prevalence 1.1 Articolo in rivista 2020 Ruokolainen, Lasse; Fyhrquist, Nanna; Laatikainen, Tiina; Auvinen, Petri; Fortino, Vittorio; Scala, Giovanni; Jousilahti, Pekka; Karisola, Piia; Vendelin, Johanna; Karkman, Antti; Markelova, Olga; Mäkelä, Mika J.; Lehtimäki, Sari; Ndika, Joseph; Ottman, Noora; Paalanen, Laura; Paulin, Lars; Vartiainen, Erkki; Hertzen, Leena; Greco, Dario; Haahtela, Tari; Alenius, Harri
A review of COVID-19 biomarkers and drug targets: resources and tools 1.8 Articolo in rassegna (review) 2020 Caruso, Francesca P; Scala, Giovanni; Cerulo, Luigi; Ceccarelli, Michele
Tracing and tracking epiallele families in complex DNA populations 1.1 Articolo in rivista 2020 Pezone, Antonio; Tramontano, Alfonso; Scala, Giovanni; Cuomo, Mariella; Riccio, Patrizia; De Nicola, Sergio; Porcellini, Antonio; Chiariotti, Lorenzo; Avvedimento, VITTORIO ENRICO
Phosphorylation of NFATC1 at PIM1 target sites is essential for its ability to promote prostate cancer cell migration and invasion 1.1 Articolo in rivista 2019 Eerola, Sini K.; Santio, Niina M.; Rinne, Sanni; Kouvonen, Petri; Corthals, Garry L.; Scaravilli, Mauro; Scala, Giovanni; Serra, Angela; Greco, Dario; Ruusuvuori, Pekka; Latonen, Leena; Rainio, Eeva-Marja; Visakorpi, Tapio; Koskinen, Päivi J.
eUTOPIA: SolUTion for Omics data PreprocessIng and Analysis 1.1 Articolo in rivista 2019 Marwah, V. S.; Scala, G.; Kinaret, P. A. S.; Serra, A.; Alenius, H.; Fortino, V.; Greco, D.
Gain-of-function CEBPE mutation causes noncanonical autoinflammatory inflammasomopathy 1.1 Articolo in rivista 2019 Goos, H.; Fogarty, C. L.; Sahu, B.; Plagnol, V.; Rajamaki, K.; Nurmi, K.; Liu, X.; Einarsdottir, E.; Jouppila, A.; Pettersson, T.; Vihinen, H.; Krjutskov, K.; Saavalainen, P.; Jarvinen, A.; Muurinen, M.; Greco, D.; Scala, G.; Curtis, J.; Nordstrom, D.; Flaumenhaft, R.; Vaarala, O.; Kovanen, P. E.; Keskitalo, S.; Ranki, A.; Kere, J.; Lehto, M.; Notarangelo, L. D.; Nejentsev, S.; Eklund, K. K.; Varjosalo, M.; Taipale, J.; Seppanen, M. R. J.
FunMappOne: A tool to hierarchically organize and visually navigate functional gene annotations in multiple experiments 1.1 Articolo in rivista 2019 Scala, G.; Serra, A.; Marwah, V. S.; Saarimaki, L. A.; Greco, D.
Genome-wide mapping of 8-oxo-7,8-dihydro-2'-deoxyguanosine reveals accumulation of oxidatively-generated damage at DNA replication origins within transcribed long genes of mammalian cells 1.1 Articolo in rivista 2019 Amente, Stefano; Di Palo, Giacomo; Scala, Giovanni; Castrignanò, Tiziana; Gorini, Francesca; Cocozza, Sergio; Amoresano, Angela; Pucci, Piero; Ma, Bin; Stepanov, Irina; Lania, Luigi; Pelicci, Pier Giuseppe; Dellino, Gaetano Ivan; Majello, Barbara
INfORM: Inference of NetwOrk Response Modules 1.1 Articolo in rivista 2018 Marwah, V. S.; Kinaret, P. A. S.; Serra, A.; Scala, G.; Lauerma, A.; Fortino, V.; Greco, D.
Multi-omics analysis of ten carbon nanomaterials effects highlights cell type specific patterns of molecular regulation and adaptation 1.1 Articolo in rivista 2018 Scala, G.; Kinaret, P.; Marwah, V.; Sund, J.; Fortino, V.; Greco, D.
Cholesteatoma vs granulation tissue: a differential diagnosis by DWI-MRI apparent diffusion coefficient 1.1 Articolo in rivista 2018 Cavaliere, M; Di Lullo, Antonella Miriam; Cantone, E; Scala, G; Elefante, A; Russo, C; Brunetti, L; Motta, G; Iengo, M
Integration of genome-wide mRNA and miRNA expression, and DNA methylation data of three cell lines exposed to ten carbon nanomaterials 1.1 Articolo in rivista 2018 Scala, Giovanni; Marwah, Veer; Kinaret, Pia; Sund, Jukka; Fortino, Vittorio; Greco, Dario
Identification of C12orf4 as a gene for autosomal recessive intellectual disability 1.1 Articolo in rivista 2017 Philips, A. K.; Pinelli, M.; de Bie, C. I.; Mustonen, A.; Maatta, T.; Arts, H. H.; Wu, K.; Roepman, R.; Moilanen, J. S.; Raza, S.; Varilo, T.; Scala, G.; Cocozza, S.; Gilissen, C.; van Gassen, K. L. I.; Jarvela, I.
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