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: Accurate diagnosis for patients living with neurodevelopmental disorders is often met with numerous challenges, related to the ambiguity of findings and lack of specificity in genetic variants leading to pathology. Genome-wide DNA methylation analysis has been used to develop highly sensitive and specific 'episignatures' as biomarkers capable of differentiating and classifying complex neurodevelopmental disorders. In this study we describe distinct episignatures for KAT6A syndrome, caused by pathogenic variants in the lysine acetyltransferase A gene (KAT6A), and for the two neurodevelopmental disorders associated with lysine acetyl transferase B (KAT6B). We demonstrate the ability of our models to differentiate between highly overlapping episignatures, increasing the ability to effectively identify and diagnose these conditions.
DNA methylation episignatures are sensitive and specific biomarkers for detection of patients with KAT6A/KAT6B variants / Vos, N., Reilly, J., Elting, M.W., Campeau, P.M., Coman, D., Stark, Z., Tan, T.Y., Amor, D.J., Kaur, S., Stjohn, M., Morgan, A.T., Kamien, B.A., Patel, C., Tedder, M.L., Merla, G., Prontera, P., Castori, M., Muru, K., Collins, F., Christodoulou, J., et al.. - In: EPIGENOMICS. - ISSN 1750-1911. - (2023). [10.2217/epi-2023-0079]
DNA methylation episignatures are sensitive and specific biomarkers for detection of patients with KAT6A/KAT6B variants
Vos, Niels;Reilly, Jack;Elting, Mariet W;Campeau, Philippe M;Coman, David;Stark, Zornitza;Tan, Tiong Yang;Amor, David J;Kaur, Simran;StJohn, Miya;Morgan, Angela T;Kamien, Benjamin A;Patel, Chirag;Tedder, Matthew L;Merla, Giuseppe;Prontera, Paolo;Castori, Marco;Muru, Kai;Collins, Felicity;Christodoulou, John;Smith, Janine;Zeev, Bruria Ben;Murgia, Alessandra;Leonardi, Emanuela;Esber, Natacha;Martinez-Monseny, Antonio;Casas-Alba, Didac;Wallis, Matthew;Mannens, Marcel;Levy, Michael A;Relator, Raissa;Alders, Marielle;Sadikovic, Bekim
2023
Abstract
: Accurate diagnosis for patients living with neurodevelopmental disorders is often met with numerous challenges, related to the ambiguity of findings and lack of specificity in genetic variants leading to pathology. Genome-wide DNA methylation analysis has been used to develop highly sensitive and specific 'episignatures' as biomarkers capable of differentiating and classifying complex neurodevelopmental disorders. In this study we describe distinct episignatures for KAT6A syndrome, caused by pathogenic variants in the lysine acetyltransferase A gene (KAT6A), and for the two neurodevelopmental disorders associated with lysine acetyl transferase B (KAT6B). We demonstrate the ability of our models to differentiate between highly overlapping episignatures, increasing the ability to effectively identify and diagnose these conditions.
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.