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IRIS
Progress in genome sequencing
now enables the large-scale
generation of reference genomes.
Various international initiatives
aim to generate reference genomes
representing global biodiversity.
These genomes provide
unique insights into genomic diversity
and architecture, thereby enabling
comprehensive analyses
of population and functional
genomics, and are expected
to revolutionize conservation
genomics.
The era of reference genomes in conservation genomics / Formenti, Giulio; Theissinger, Kathrin; Fernandes, Carlos; Bista, Iliana; Bombarely, Aureliano; Bleidorn, Christoph; Ciofi, Claudio; Crottini, Angelica; Godoy, José A.; Höglund, Jacob; Malukiewicz, Joanna; Mouton, Alice; Oomen, Rebekah A.; Paez, Sadye; Palsbøll, Per J.; Pampoulie, Christophe; Ruiz-López, María J.; Svardal, Hannes; Theofanopoulou, Constantina; de Vries, Jan; Waldvogel, Ann-Marie; Zhang, Guojie; Mazzoni, Camila J.; Jarvis, Erich D.; Bálint, Miklós; Formenti, Giulio; Theissinger, Kathrin; Fernandes, Carlos; Bista, Iliana; Bombarely, Aureliano; Bleidorn, Christoph; Čiampor, Fedor; Ciofi, Claudio; Crottini, Angelica; Godoy, José A.; Hoglund, Jacob; Malukiewicz, Joanna; Mouton, Alice; Oomen, Rebekah A.; Paez, Sadye; Palsbøll, Per; Pampoulie, Christophe; José Ruiz-López, María; Svardal, Hannes; Theofanopoulou, Constantina; de Vries, Jan; Waldvogel, Ann-Marie; Zhang, Goujie; Mazzoni, Camila J.; Jarvis, Erich; Bálint, Miklós; Aghayan, Sargis A.; Alioto, Tyler S.; Almudi, Isabel; Alvarez, Nadir; Alves, Paulo C.; R Amorim, Isabel; Antunes, Agostinho; Arribas, Paula; Baldrian, Petr; R Berg, Paul; Bertorelle, Giorgio; Böhne, Astrid; Bonisoli-Alquati, Andrea; L Boštjančić, Ljudevit; Boussau, Bastien; M Breton, Catherine; Buzan, Elena; F Campos, Paula; Carreras, Carlos; FIlipe Castro, L.; Chueca, Luis J.; Conti, Elena; Cook-Deegan, Robert; Croll, Daniel; V Cunha, Mónica; Delsuc, Frédéric; Dennis, Alice B.; Dimitrov, Dimitar; Faria, Rui; Favre, Adrien; Fedrigo, Olivier D.; Fernández, Rosa; Francesco Ficetola, Gentile; Flot, Jean-François; Gabaldón, Toni; Galea Agius, Dolores R.; Gallo, Guido R.; Giani, Alice M.; Thomas P Gilbert, M.; Grebenc, Tine; Guschanski, Katerina; Guyot, Romain; Hausdorf, Bernhard; Hawlitschek, Oliver; D Heintzman, Peter; Heinze, Berthold; Hiller, Michael; Husemann, Martin; Iannucci, Alessio; Irisarri, Iker; S Jakobsen, Kjetill; Jentoft, Sissel; Klinga, Peter; Kloch, Agnieszka; F Kratochwil, Claudius; Kusche, Henrik; KS Layton, Kara; A Leonard, Jennifer; Lerat, Emmanuelle; Liti, Gianni; Manousaki, Tereza; Marques-Bonet, Tomas; Matos-Maraví, Pável; Matschiner, Michael; Maumus, Florian; Mc Cartney, Ann M.; Meiri, Shai; Melo-Ferreira, José; Mengual, Ximo; Monaghan, Michael T.; Montagna, Matteo; Robertwmysłajek, ; T Neiber, Marco; Nicolas, Violaine; Novo, Marta; Ozretić, Petar; Palero, Ferran; Pârvulescu, Lucian; Pascual, Marta; Paulo, Octávio S.; Pavlek, Martina; Pegueroles, Cinta; Pellissier, Loc; Pesole, Graziano; R Primmer, Craig; Riesgo, Ana; Rüber, Lukas; Rubolini, Diego; Salvi, Daniele; Seehausen, Ole; Seidel, Matthias; Secomandi, Simona; Studer, Bruno; Theodoridis, Spyros; Thines, Marco; Urban, Lara; Vasemägi, Anti; Vella, Adriana; Vella, Noel; C Vernes, Sonja; Vernesi, Cristiano; R Vieites, David; M Waterhouse, Robert; W Wheat, Christopher; Wörheide, Gert; Wurm, Yannick; Zammit., and Gabrielle. - In: TRENDS IN ECOLOGY & EVOLUTION. - ISSN 0169-5347. - 37:3(2022).
The era of reference genomes in conservation genomics
Giulio Formenti;Kathrin Theissinger;Carlos Fernandes;Iliana Bista;Aureliano Bombarely;Christoph Bleidorn;Claudio Ciofi;Angelica Crottini;José A. Godoy;Jacob Höglund;Joanna Malukiewicz;Alice Mouton;Rebekah A. Oomen;Sadye Paez;Per J. Palsbøll;Christophe Pampoulie;María J. Ruiz-López;Hannes Svardal;Constantina Theofanopoulou;Jan de Vries;Ann-Marie Waldvogel;Guojie Zhang;Camila J. Mazzoni;Erich D. Jarvis;Miklós Bálint;Giulio Formenti;Kathrin Theissinger;Carlos Fernandes;Iliana Bista;Aureliano Bombarely;Christoph Bleidorn;Fedor Čiampor;Claudio Ciofi;Angelica Crottini;José A. Godoy;Jacob Hoglund;Joanna Malukiewicz;Alice Mouton;Rebekah A. Oomen;Sadye Paez;Per Palsbøll;Christophe Pampoulie;María José Ruiz-López;Hannes Svardal;Constantina Theofanopoulou;Jan de Vries;Ann-Marie Waldvogel;Goujie Zhang;Camila J. Mazzoni;Erich Jarvis;Miklós Bálint;Sargis A. Aghayan;Tyler S. Alioto;Isabel Almudi;Nadir Alvarez;Paulo C. Alves;Isabel R Amorim;Agostinho Antunes;Paula Arribas;Petr Baldrian;Paul R Berg;Giorgio Bertorelle;Astrid Böhne;Andrea Bonisoli-Alquati;Ljudevit L Boštjančić;Bastien Boussau;Catherine M Breton;Elena Buzan;Paula F Campos;Carlos Carreras;L. FIlipe Castro;Luis J. Chueca;Elena Conti;Robert Cook-Deegan;Daniel Croll;Mónica V Cunha;Frédéric Delsuc;Alice B. Dennis;Dimitar Dimitrov;Rui Faria;Adrien Favre;Olivier D. Fedrigo;Rosa Fernández;Gentile Francesco Ficetola;Jean-François Flot;Toni Gabaldón;Dolores R. Galea Agius;Guido R. Gallo;Alice M. Giani;M. Thomas P Gilbert;Tine Grebenc;Katerina Guschanski;Romain Guyot;Bernhard Hausdorf;Oliver Hawlitschek;Peter D Heintzman;Berthold Heinze;Michael Hiller;Martin Husemann;Alessio Iannucci;Iker Irisarri;Kjetill S Jakobsen;Sissel Jentoft;Peter Klinga;Agnieszka Kloch;Claudius F Kratochwil;Henrik Kusche;Kara KS Layton;Jennifer A Leonard;Emmanuelle Lerat;Gianni Liti;Tereza Manousaki;Tomas Marques-Bonet;Pável Matos-Maraví;Michael Matschiner;Florian Maumus;Ann M. Mc Cartney;Shai Meiri;José Melo-Ferreira;Ximo Mengual;Michael T. Monaghan;Matteo Montagna;RobertWMysłajek;Marco T Neiber;Violaine Nicolas;Marta Novo;Petar Ozretić;Ferran Palero;Lucian Pârvulescu;Marta Pascual;Octávio S. Paulo;Martina Pavlek;Cinta Pegueroles;Loc Pellissier;Graziano Pesole;Craig R Primmer;Ana Riesgo;Lukas Rüber;Diego Rubolini;Daniele Salvi;Ole Seehausen;Matthias Seidel;Simona Secomandi;Bruno Studer;Spyros Theodoridis;Marco Thines;Lara Urban;Anti Vasemägi;Adriana Vella;Noel Vella;Sonja C Vernes;Cristiano Vernesi;David R Vieites;Robert M Waterhouse;Christopher W Wheat;Gert Wörheide;Yannick Wurm;and Gabrielle Zammit.
2022
Abstract
Progress in genome sequencing
now enables the large-scale
generation of reference genomes.
Various international initiatives
aim to generate reference genomes
representing global biodiversity.
These genomes provide
unique insights into genomic diversity
and architecture, thereby enabling
comprehensive analyses
of population and functional
genomics, and are expected
to revolutionize conservation
genomics.
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
