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Next generation sequencing (NGS) represents a key diagnostic tool to identify clinically relevant gene alterations for treatment-decision making in cancer care. However, the complex manual workflow required for NGS has limited its implementation in routine clinical practice. In this worldwide study, we validated the clinical performance of the TargetPlex FFPE-Direct DNA Library Preparation Kit for NGS analysis. Impressively, this new assay obviates the need for separate, labour intensive and time-consuming pre-analytical steps of DNA extraction, purification and isolation from formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) specimens in the NGS workflow.
TargetPlex FFPE-Direct DNA Library Preparation Kit for SiRe NGS panel: an international performance evaluation study / Malapelle, U., Pepe, F., Pisapia, P., Sgariglia, R., Nacchio, M., Barberis, M., Bilh, M., Bubendorf, L., Büttner, R., Cabibi, D., Castiglia, M., De Andrea, C.E., De Biase, D., Dumur, C.I., Fontanini, G., Freire, J., Gristina, V., Hofman, P., Ilie, M., Lozano, M.D., et al.. - In: JOURNAL OF CLINICAL PATHOLOGY. - ISSN 0021-9746. - 75:(2022), pp. 416-421. [10.1136/jclinpath-2021-207450]
TargetPlex FFPE-Direct DNA Library Preparation Kit for SiRe NGS panel: an international performance evaluation study
Next generation sequencing (NGS) represents a key diagnostic tool to identify clinically relevant gene alterations for treatment-decision making in cancer care. However, the complex manual workflow required for NGS has limited its implementation in routine clinical practice. In this worldwide study, we validated the clinical performance of the TargetPlex FFPE-Direct DNA Library Preparation Kit for NGS analysis. Impressively, this new assay obviates the need for separate, labour intensive and time-consuming pre-analytical steps of DNA extraction, purification and isolation from formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) specimens in the NGS workflow.
TargetPlex FFPE-Direct DNA Library Preparation Kit for SiRe NGS panel: an international performance evaluation study / Malapelle, U., Pepe, F., Pisapia, P., Sgariglia, R., Nacchio, M., Barberis, M., Bilh, M., Bubendorf, L., Büttner, R., Cabibi, D., Castiglia, M., De Andrea, C.E., De Biase, D., Dumur, C.I., Fontanini, G., Freire, J., Gristina, V., Hofman, P., Ilie, M., Lozano, M.D., et al.. - In: JOURNAL OF CLINICAL PATHOLOGY. - ISSN 0021-9746. - 75:(2022), pp. 416-421. [10.1136/jclinpath-2021-207450]
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/11588/848775
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
