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Intestinal microbiota influences clinical outcome and side effects of early breast cancer treatment 1.1 Articolo in rivista 2021 Terrisse, Safae; Derosa, Lisa; Iebba, Valerio; Ghiringhelli, François; Vaz-Luis, Ines; Kroemer, Guido; Fidelle, Marine; Christodoulidis, Stergios; Segata, Nicola; Thomas, Andrew Maltez; Martin, Anne-Laure; Sirven, Aude; Everhard, Sibille; Aprahamian, Fanny; Nirmalathasan, Nitharsshini; Aarnoutse, Romy; Smidt, Marjolein; Ziemons, Janine; Caldas, Carlos; Loibl, Sibylle; Denkert, Carsten; Durand, Sylvere; Iglesias, Claudia; Pietrantonio, Filippo; Routy, Bertrand; André, Fabrice; Pasolli, Edoardo; Delaloge, Suzette; Zitvogel, Laurence
Use of process-based system dynamic models to generate biologically aware 3D trees 8.02 Comunicazioni a Convegni o Seminari 2020 Crimaldi, Mariano; Pasolli, Edoardo; Giannino, Francesco
Large-scale genome-wide analysis links lactic acid bacteria from food with the gut microbiome 1.1 Articolo in rivista 2020 Pasolli, E.; De Filippis, F.; Mauriello, I. E.; Cumbo, F.; Walsh, A. M.; Leech, J.; Cotter, P. D.; Segata, N.; Ercolini, D.
Cross-reactivity between tumor MHC class I-restricted antigens and an enterococcal bacteriophage 1.1 Articolo in rivista 2020 Fluckiger, A.; Daillere, R.; Sassi, M.; Sixt, B. S.; Liu, P.; Loos, F.; Richard, C.; Rabu, C.; Alou, M. T.; Goubet, A. -G.; Lemaitre, F.; Ferrere, G.; Derosa, L.; Duong, C. P. M.; Messaoudene, M.; Gagne, A.; Joubert, P.; De Sordi, L.; Debarbieux, L.; Simon, S.; Scarlata, C. -M.; Ayyoub, M.; Palermo, B.; Facciolo, F.; Boidot, R.; Wheeler, R.; Boneca, I. G.; Sztupinszki, Z.; Papp, K.; Csabai, I.; Pasolli, E.; Segata, N.; Lopez-Otin, C.; Szallasi, Z.; Andre, F.; Iebba, V.; Quiniou, V.; Klatzmann, D.; Boukhalil, J.; Khelaifia, S.; Raoult, D.; Albiges, L.; Escudier, B.; Eggermont, A.; Mami-Chouaib, F.; Nistico, P.; Ghiringhelli, F.; Routy, B.; Labarriere, N.; Cattoir, V.; Kroemer, G.; Zitvogel, L.
Strong oral plaque microbiome signatures for dental implant diseases identified by strain-resolution metagenomics 1.1 Articolo in rivista 2020 Ghensi, P.; Manghi, P.; Zolfo, M.; Armanini, F.; Pasolli, E.; Bolzan, M.; Bertelle, A.; Dell'Acqua, F.; Dellasega, E.; Waldner, R.; Tessarolo, F.; Tomasi, C.; Segata, N.
The food-gut axis: lactic acid bacteria and their link to food, the gut microbiome and human health 1.1 Articolo in rivista 2020 De Filippis, F.; Pasolli, E.; Ercolini, D.
Harmonized landsat 8 and sentinel-2 time series data to detect irrigated areas: An application in Southern Italy 1.1 Articolo in rivista 2020 Bolognesi, S. F.; Pasolli, E.; Belfiore, O. R.; De Michele, C.; D'Urso, G.
Precise phylogenetic analysis of microbial isolates and genomes from metagenomes using PhyloPhlAn 3.0 1.1 Articolo in rivista 2020 Asnicar, F.; Thomas, A. M.; Beghini, F.; Mengoni, C.; Manara, S.; Manghi, P.; Zhu, Q.; Bolzan, M.; Cumbo, F.; May, U.; Sanders, J. G.; Zolfo, M.; Kopylova, E.; Pasolli, E.; Knight, R.; Mirarab, S.; Huttenhower, C.; Segata, N.
Gut Bacteria Composition Drives Primary Resistance to Cancer Immunotherapy in Renal Cell Carcinoma Patients 1.1 Articolo in rivista 2020 Derosa, L.; Routy, B.; Fidelle, M.; Iebba, V.; Alla, L.; Pasolli, E.; Segata, N.; Desnoyer, A.; Pietrantonio, F.; Ferrere, G.; Fahrner, J. -E.; Le Chatellier, E.; Pons, N.; Galleron, N.; Roume, H.; Duong, C. P. M.; Mondragon, L.; Iribarren, K.; Bonvalet, M.; Terrisse, S.; Rauber, C.; Goubet, A. -G.; Daillere, R.; Lemaitre, F.; Reni, A.; Casu, B.; Alou, M. T.; Alves Costa Silva, C.; Raoult, D.; Fizazi, K.; Escudier, B.; Kroemer, G.; Albiges, L.; Zitvogel, L.
Newly Explored Faecalibacterium Diversity Is Connected to Age, Lifestyle, Geography, and Disease 1.1 Articolo in rivista 2020 DE FILIPPIS, Francesca; Pasolli, Edoardo; Ercolini, Danilo
An Adaptive Multiview Active Learning Approach for Spectral-Spatial Classification of Hyperspectral Images 1.1 Articolo in rivista 2020 Zhang, Z.; Pasolli, E.; Crawford, M. M.
Analysis of 1321 Eubacterium rectale genomes from metagenomes uncovers complex phylogeographic population structure and subspecies functional adaptations 1.1 Articolo in rivista 2020 Karcher, N.; Pasolli, E.; Asnicar, F.; Huang, K. D.; Huang, K. D.; Tett, A.; Manara, S.; Armanini, F.; Bain, D.; Duncan, S. H.; Louis, P.; Zolfo, M.; Manghi, P.; Valles-Colomer, M.; Raffaeta, R.; Rota-Stabelli, O.; Collado, M. C.; Zeller, G.; Falush, D.; Maixner, F.; Walker, A. W.; Huttenhower, C.; Huttenhower, C.; Segata, N.
Mediterranean diet intervention in overweight and obese subjects lowers plasma cholesterol and causes changes in the gut microbiome and metabolome independently of energy intake 1.1 Articolo in rivista 2020 Meslier, Victoria; Laiola, Manolo; Roager, Henrik Munch; De Filippis, Francesca; Roume, Hugo; Quinquis, Benoit; Giacco, Rosalba; Mennella, Ilario; Ferracane, Rosalia; Pons, Nicolas; Pasolli, Edoardo; Rivellese, Angela; Dragsted, Lars Ove; Vitaglione, Paola; Ehrlich, Stanislav Dusko; Ercolini, Danilo
Advances in hyperspectral image classification methods for vegetation and agricultural cropland studies 2.1 Contributo in volume (Capitolo o Saggio) 2019 Pasolli, Edoardo; Prasad, Saurabh; Crawford, Melba M.; Tilton, James C.
Extensive Unexplored Human Microbiome Diversity Revealed by Over 150,000 Genomes from Metagenomes Spanning Age, Geography, and Lifestyle 1.1 Articolo in rivista 2019 Pasolli, Edoardo; Asnicar, Francesco; Manara, Serena; Zolfo, Moreno; Karcher, Nicolai; Armanini, Federica; Beghini, Francesco; Manghi, Paolo; Tett, Adrian; Ghensi, Paolo; Collado, Maria Carmen; Rice, Benjamin L.; Dulong, Casey; Morgan, Xochitl C.; Golden, Christopher D.; Quince, Christopher; Huttenhower, Curtis; Segata, Nicola
The Prevotella copri Complex Comprises Four Distinct Clades Underrepresented in Westernized Populations 1.1 Articolo in rivista 2019 Tett, Adrian; Huang, Kun D; Asnicar, Francesco; Fehlner-Peach, Hannah; Pasolli, Edoardo; Karcher, Nicolai; Armanini, Federica; Manghi, Paolo; Bonham, Kevin; Zolfo, Moreno; De Filippis, Francesca; Magnabosco, Cara; Bonneau, Richard; Lusingu, John; Amuasi, John; Reinhard, Karl; Rattei, Thomas; Boulund, Fredrik; Engstrand, Lars; Zink, Albert; Collado, Maria Carmen; Littman, Dan R; Eibach, Daniel; Ercolini, Danilo; Rota-Stabelli, Omar; Huttenhower, Curtis; Maixner, Frank; Segata, Nicola
Post-Disaster Building Database Updating Using Automated Deep Learning: An Integration of Pre-Disaster OpenStreetMap and Multi-Temporal Satellite Data 1.1 Articolo in rivista 2019 Ghaffarian, Saman; Kerle, Norman; Pasolli, Edoardo; Jokar Arsanjani, Jamal
Methicillin-resistant Staphylococcus aureus eradication in cystic fibrosis patients: A randomized multicenter study 1.1 Articolo in rivista 2019 Dolce, Daniela; Stella, Neri; Grisotto, Laura; Campana, Silvia; Ravenni, Novella; Miselli, Francesca; Camera, Erica; Zavataro, Lucia; Braggion, Cesare; Fiscarelli, Ersilia V.; Lucidi, Vincenzina; Cariani, Lisa; Girelli, Daniela; Faelli, Nadia; Colombo, Carla; Lucanto, Cristina; Lombardo, Mariangela; Magazzù, Giuseppe; Tosco, Antonella; Raia, Valeria; Manara, Serena; Pasolli, Edoardo; Armanini, Federica; Segata, Nicola; Biggeri, Annibale; Taccetti, Giovanni
Crop Mapping through an Adaptive Multiview Active Learning Strategy 4.1 Articoli in Atti di convegno 2019 Zhang, Z.; Pasolli, E.; Crawford, M. M.
Distinct Genetic and Functional Traits of Human Intestinal Prevotella copri Strains Are Associated with Different Habitual Diets 1.1 Articolo in rivista 2019 De Filippis, Francesca; Pasolli, Edoardo; Tett, Adrian; Tarallo, Sonia; Naccarati, Alessio; De Angelis, Maria; Neviani, Erasmo; Cocolin, Luca; Gobbetti, Marco; Segata, Nicola; Ercolini, Danilo
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